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Chapitre 6. Maintenance et mise à jour : les outils APT

6.1. Renseigner le fichier sources.list
6.1.1. Syntaxe
6.1.2. Dépôts pour les utilisateurs de Stable
6.1.3. Dépôts pour les utilisateurs de Testing/Unstable
6.1.4. Using Alternate Mirrors
6.1.5. Ressources non officielles : mentors.debian.net
6.1.6. Mandataire avec cache (proxy-cache) pour paquets Debian
6.2. Commandes aptitude, apt-get et apt
6.2.1. Initialisation
6.2.2. Installation et suppression
6.2.3. Mise à jour
6.2.4. Options de configuration
6.2.5. Gérer les priorités associées aux paquets
6.2.6. Travailler avec plusieurs distributions
6.2.7. Suivi des paquets installés automatiquement
6.2.8. APT Patterns
6.3. Commande apt-cache
6.3.1. The apt-cache policy Command
6.4. The apt-file Command
6.5. Frontaux : aptitude, synaptic
6.5.1. aptitude
6.5.2. synaptic
6.6. Vérification d'authenticité des paquets
6.7. Mise à jour d'une distribution à la suivante
6.7.1. Démarche à suivre
6.7.2. Gérer les problèmes consécutifs à une mise à jour
6.7.3. Cleaning Up after an Upgrade
6.8. Maintenir un système à jour
6.9. Mise à jour automatique
6.9.1. Configuration de dpkg
6.9.2. Configuration d'APT
6.9.3. Configuration de debconf
6.9.4. Gestion des interactions en ligne de commande
6.9.5. La combinaison miracle
6.10. Recherche de paquets
Ce qui rend Debian si populaire auprès des administrateurs, c'est la facilité avec laquelle il est possible d'y installer des logiciels et de mettre à jour le système complet. Cet avantage unique est dû en grande partie au programme APT, outil dont les administrateurs de Falcot SA ont étudié avec enthousiasme.
APT is the abbreviation for Advanced Packaging Tool. What makes this program “advanced” is its approach to packages. It doesn't simply evaluate them individually, but it considers them as a whole and produces the best possible combination of packages depending on what is available and compatible according to dependencies.

VOCABULAIRE Source de paquets et paquet source

Le terme source peut porter à confusion. Il ne faut pas confondre "un paquet source" — paquet contenant le code source d'un programme — et une "source de paquets" — emplacement (site web, serveur FTP, CD-Rom, répertoire local, etc.) contenant des paquets.
APT a besoin qu'on lui fournisse une « liste de sources de paquets (dépôts) » : c'est le fichier /etc/apt/sources.list qui listera les différents emplacements publiant des paquets Debian. APT devra ensuite importer la liste des paquets publiés par chacune de ces sources. Il réalise cette opération en téléchargeant les fichiers Packages.xz ou une variante (tel que Packages.gz or .bz2 (qui utilise différentes méthodes de compressions) dans le cas d'une source de paquets binaires et en analysant son contenu. Dans le cas de la source d'une source de paquets, APT télécharge les fichiers Sources.xz ou une variante utilisant une méthode de compression différente. Lorsque l'on dispose déjà d'une copie ancienne de ces fichiers, APT est capable de les mettre à jour en ne téléchargeant que les différences (voir encadré TIP Incremental updates).

RETOUR AUX BASES. Compression gzip, bzip2, LZMA et XZ

Une extension .gz dénote un fichier compressé avec l'utilitaire gzip, qui est l'utilitaire Unix traditionnel pour compresser les fichiers, rapide et efficace. De nouveaux outils, plus récents, obtiennent de meilleurs taux de compression mais nécessitent plus de ressources (temps de calcul et mémoire) pour comprimer ou décomprimer un fichier. Par ordre d'apparition, citons bzip2 (qui produit des fichiers d'extension .bz2), LZMA (qui produit des .lzma) et xz (qui produit des .xz).

6.1. Renseigner le fichier sources.list

6.1.1. Syntaxe

Chaque ligne active du fichier /etc/apt/sources.list représente un paquet source (dépôt) et est composée d'au moins trois parties séparées par des espaces. Pour une description complète du format de fichier et de la composition des entrées acceptées, voir sources.list(5).

Exemple 6.1. Example entry format in /etc/apt/sources.list

deb url distribution composant1 composant2 composant3 [..] composantX
deb-src url distribution composant1 composant2 composant3 [..] composantX
……
Le premier champ indique le type de la source :
deb
source (dépôt) de paquets binaires
deb-src
source (dépôt) de paquets binaires
The second field gives the base URL of the source. Combined with the filenames listed in the Packages.xz files, it must give a full and valid URL. This can consist in a Debian mirror or in any other package archive set up by a third party. The URL can start with file:// to indicate a local source installed in the system's file hierarchy, with http:// or https:// to indicate a source accessible from a web server, or with ftp:// or ftps:// for a source available on an FTP server. The URL can also start with cdrom: for CD-ROM/DVD/Blu-ray disc based installations, although this is less frequent, since network-based installation methods are eventually more common. More methods like ssh:// or tor+http(s):// are supported and are either described in sources.list(5) or their respective apt-transport-method package documentation.
The syntax of the last field depends on the structure of the repository. In the simplest case, you can simply indicate a subdirectory (with a required trailing slash) of the desired source. This is often a simple “./” which refers to the absence of a subdirectory. The packages are then directly at the specified URL. But in the most common case, the repositories will be structured like a Debian mirror, with multiple distributions, each having multiple components. In those cases, name the chosen distribution by its “codename” — see the list in sidebar COMMUNAUTÉ Bruce Perens, un leader chahuté — or by the corresponding “suite” (oldoldstable, oldstable, stable, testing, unstable) and then the components to enable. A typical Debian mirror provides the components main, contrib, and non-free.

VOCABULAIRE Les archives main, contrib et non-free

Debian uses three components to differentiate packages according to the licenses chosen by the authors of each work. Main gathers all packages which fully comply with the Debian Free Software Guidelines.
The non-free component is different because it contains software which does not (entirely) conform to these principles but which can, nevertheless, be distributed without restrictions. This archive, which is not officially part of Debian, is a service for users who could need some of those programs and, nowadays, also require the firmware for their hardware. However, Debian always recommends giving priority to free software. The existence of this component represents a considerable problem for Richard M. Stallman and keeps the Free Software Foundation from recommending Debian to users.
Contrib (contributions) is a set of open source software which cannot function without some non-free elements — these elements can be software from the non-free section, or non-free files such as game ROMs, BIOS of consoles, etc. — or some elements, not available from the Debian main archive at all. The contrib component also includes free software whose compilation requires proprietary elements. This was initially the case for the OpenOffice.org office suite, which used to require a proprietary Java environment.

ASTUCE Fichiers dans /etc/apt/sources.list.d/

Si de nombreuses sources de paquets sont référencées, il peut être utile de les séparer en plusieurs fichiers, chaque fragment étant stocké dans un /etc/apt/sources.list.d/fichier.list (voir encadré B.A.-BA Répertoire en .d).
Les entrées cdrom décrivent les CD/DVD-Rom Debian dont vous disposez. Contrairement aux autres entrées, un CD-Rom n'est pas disponible en permanence puisqu'il faut l'insérer dans le lecteur et qu'un seul disque peut être lu à la fois — ces sources sont donc gérées un peu différemment. On ajoutera ces entrées à l'aide du petit programme apt-cdrom, habituellement invoqué avec le paramètre add. Ce dernier demande alors d'insérer le disque dans le lecteur et parcourt son contenu à la recherche de fichiers Packages, qu'il utilisera pour mettre à jour sa base de données de paquets disponibles (opération habituellement réalisée par la commande apt update). Dès lors, APT pourra vous demander d'insérer le disque en question s'il a besoin de l'un de ses paquets.

6.1.2. Dépôts pour les utilisateurs de Stable

Voici le contenu standard du fichier sources.list pour un système fonctionnant avec la version Stable de Debian :

Exemple 6.2. Fichier /etc/apt/sources.list pour les utilisateurs de Debian Stable

# Security updates
deb http://security.debian.org/ bullseye-security main contrib non-free
deb-src http://security.debian.org/ bullseye-security main contrib non-free

## Debian mirror

# Base repository
deb https://deb.debian.org/debian bullseye main contrib non-free
deb-src https://deb.debian.org/debian bullseye main contrib non-free

# Stable updates
deb https://deb.debian.org/debian bullseye-updates main contrib non-free
deb-src https://deb.debian.org/debian bullseye-updates main contrib non-free

# Stable backports
deb https://deb.debian.org/debian bullseye-backports main contrib non-free
deb-src https://deb.debian.org/debian bullseye-backports main contrib non-free
This file lists all sources of packages associated with the Bullseye version of Debian (the current Stable suite as of this writing). In the example above, we opted to name “bullseye” explicitly instead of using the corresponding “stable“ aliases (stable, stable-updates, stable-backports) because we don't want to have the underlying distribution changed outside of our control when the next stable release comes out.
Most packages will come from the “base repository”, which contains all packages but is seldom updated (about once every 2 months for a “point release”). The other repositories are partial (they do not contain all packages) and can host updates (packages with newer version) that APT might install. The following sections will explain the purpose and the rules governing each of those repositories.
Il est à noter que lorsque la version souhaitée d'un paquet est disponible sur plusieurs dépôts, le paquet sera téléchargé sur le premier de ces dépôts mentionnés dans le fichier sources.list. C'est pour cette raison que l'on place généralement les sources non officielles à la fin du fichier.
Notons au passage que la plupart de ce que cette section mentionne à propos de Stable s'applique également à Oldstable, puisque cette dernière distribution est simplement une version Stable plus ancienne qui reste maintenue en parallèle.

6.1.2.1. Mises à jour de sécurité

Debian takes security seriously. Known software vulnerabilities in Debian are tracked in the Security Bug Tracker and usually get fixed in a reasonable timeframe. The security updates are not hosted on the usual network of Debian mirrors but on security.debian.org, a small set of machines maintained by the Debian System Administrators. This archive contains security updates prepared by the Debian Security Team and/or by package maintainers for the Stable and Oldstable distribution.
The server can also host security updates for Testing but this doesn't happen very often since those updates tend to reach that suite via the regular flow of updates coming from Unstable.
For serious issues, the security team issues a Debian Security Advisory (DSA) and announces it together with the security update on the mailing list (archive).

6.1.2.2. Mises à jour de la distribution stable

Les mises à jour de la distribution stable ne sont pas nécessairement liées à des problèmes de sécurité, mais elles sont tout de même considérées comme suffisamment importantes pour être mises à disposition des utilisateurs avant la prochaine publication d'une version stable mise à jour (point release).
This repository will typically contain fixes for critical and serious bugs which could not be fixed before release or which have been introduced by subsequent updates. Depending on the urgency, it can also contain updates for packages that have to evolve over time, like spamassassin's spam detection rules, clamav's virus database, the daylight-saving time rules of all timezones (tzdata), the ESR version of Firefox (firefox-esr) or cryptographic keyrings like debian-archive-keyring.
In practice, this repository is a subset of the proposed-updates repository, carefully selected by the Stable Release Managers. All updates are announced on the mailing list (archive) and will be included in the next Stable point release anyway.

6.1.2.3. Mises à jour proposées

Une fois publiée, la distribution Stable n'est mise à jour que tous les 2 mois environ. Le dépôt proposed-updates contient les mises à jour qui sont proposées à l'inclusion dans Stable, sous la supervision des gestionnaires de publication stable.
Les mises à jour de sécurité et les mises à jour de la distribution stable sont toujours incluses dans ce dépôt, mais pas uniquement ; les responsables de paquets ont aussi la possibilité de corriger des problèmes qui sont importants sans toutefois justifier une publication immédiate.
Anyone can use this repository to test those updates before their official publication. The extract below uses the bullseye-proposed-updates alias which is both more explicit and more consistent since buster-proposed-updates also exists (for the Oldstable updates): 
deb https://deb.debian.org/debian bullseye-proposed-updates main contrib non-free

6.1.2.4. Rétroportages vers stable

Le dépôt stable-backports héberge des « rétroportages » de paquets (backports). Ce terme désigne un paquet d'un logiciel récent recompilé pour une distribution plus ancienne, généralement Stable.
When the distribution becomes a little dated, numerous software projects have released new versions that are not integrated into the current Stable suite, which is only modified to address the most critical problems, such as security issues. Since the Testing and Unstable suites can be more risky, package maintainers sometimes voluntarily offer recompilations of recent software applications for Stable, which has the advantage to users and system administrators to limit potential instability to a small number of chosen packages. The page https://backports.debian.org provides more information.
Les rétroportages de stable-backports sont uniquement issus de paquets disponibles dans Testing, de manière à assurer que tous les rétroportages pourront être mis à jour vers la prochaine version stable lorsqu'elle sera disponible.
Bien que ce dépôt fournisse de nouvelles versions des paquets, APT ne va les installer que sur instruction explicite (ou si un paquet concerné a déjà été mis à jour vers une version rétroportée précédente) : 
$ sudo apt-get install package/bullseye-backports
$ sudo apt-get install -t bullseye-backports package

6.1.3. Dépôts pour les utilisateurs de Testing/Unstable

Voici un fichier sources.list standard pour un système qui fonctionne avec la version Testing ou Unstable de Debian :

Exemple 6.3. Fichier /etc/apt/sources.list pour les utilisateurs de Debian Testing/Unstable

# Unstable
deb https://deb.debian.org/debian unstable main contrib non-free
deb-src https://deb.debian.org/debian unstable main contrib non-free

# Testing
deb https://deb.debian.org/debian testing main contrib non-free
deb-src https://deb.debian.org/debian testing main contrib non-free

# Testing security updates
deb http://security.debian.org/ testing-security main contrib non-free
deb-src http://security.debian.org/ testing-security main contrib non-free

# Stable
deb https://deb.debian.org/debian stable main contrib non-free
deb-src https://deb.debian.org/debian stable main contrib non-free

# Stable security updates
deb http://security.debian.org/ stable-security main contrib non-free
deb-src http://security.debian.org/ stable-security main contrib non-free

NOTE Layout of security repositories

Starting with Debian 11 Bullseye, the codename of the repository providing security updates has been renamed from codename/updates into codename-security to avoid the confusion with codename-updates (see Section 6.1.2.2, « Mises à jour de la distribution stable »).
→ https://www.debian.org/releases/bullseye/amd64/release-notes/ch-information.en.html#security-archive
With this sources.list file APT will install packages from the Unstable suite. If that is not desired, use the APT::Default-Release setting (see Section 6.2.3, « Mise à jour ») to instruct APT to pick packages from another suite (most likely Testing in this case).
There are good reasons to include all those repositories, even though a single one should be enough. Testing users will appreciate the possibility to cherry-pick a fixed package from Unstable when the version in Testing is affected by an annoying bug. On the other hand, Unstable users bitten by unexpected regressions have the possibility to downgrade packages to their (supposedly working) Testing version.
L'inclusion Stable est sujette à débat, mais elle donne souvent accès à des paquets qui ont été supprimés des versions de développement. Elle permet également de profiter des dernières mises à jour des paquets qui n'ont pas encore été modifiés depuis la publication de la dernière version stable.

6.1.3.1. Le dépôt Experimental

L'archive de paquets Experimental, présente sur tous les miroirs Debian, contient des paquets qui n'ont pas encore leur place dans la version Unstable pour cause de qualité insuffisante — ce sont fréquemment des versions de développement ou pré-versions (alpha, bêta, release candidate...) des logiciels. Il arrive également qu'un paquet y soit envoyé après avoir subi des changements importants, potentiellement sources de problèmes. Le mainteneur cherche alors à débusquer ceux-ci avec l'aide des utilisateurs avancés capables de gérer les soucis importants. Après cette première phase, le paquet passe dans Unstable, au public beaucoup plus vaste, et où il subira donc des tests de bien plus grande envergure.
On réservera donc Experimental aux utilisateurs qui n'ont pas peur de casser leur système puis de le réparer. Cette distribution peut quand même permettre de rapatrier ponctuellement un paquet que l'on tient à essayer ou utiliser. C'est d'ailleurs la logique standard que Debian lui associe, puisque son ajout dans le fichier sources.list d'APT n'entraîne pas l'emploi systématique des paquets qui s'y trouvent. La ligne qu'il convient d'ajouter est la suivante : 
deb https://deb.debian.org/debian experimental main contrib non-free

6.1.4. Using Alternate Mirrors

The sources.list examples in this chapter refer to package repositories hosted on deb.debian.org. Those URLs will redirect you to servers which are close to you and which are managed by Content Delivery Networks (CDN) whose main role is to store multiple copies of the files across the world, and to deliver them as fast as possible to users. The CDN companies that Debian is working with are Debian partners who are offering their services freely to Debian. While none of those servers are under direct control of Debian, the fact that the whole archive is sealed by GPG signatures makes it a non-issue.
→ https://deb.debian.org/
Picky users who are not satisfied with the performance of deb.debian.org can try to find a better mirror in the official mirror list:
→ https://www.debian.org/mirror/list
But when you don't know which mirror is best for you, this list is of not much use. Fortunately for you, Debian maintains DNS entries of the form ftp.country-code.debian.org (e.g. ftp.us.debian.org for the USA, ftp.fr.debian.org for France, etc.) which are covering many countries and which are pointing to one (or more) of the best mirrors available within that country.
As an alternative to deb.debian.org, there used to be httpredir.debian.org. This service would identify a mirror close to you (among the list of official mirrors, using GeoIP mainly) and would redirect APT's requests to that mirror. This service has been deprecated due to reliability concerns and now httpredir.debian.org provides the same CDN-based service as deb.debian.org.

6.1.5. Ressources non officielles : mentors.debian.net

There are numerous non-official sources of Debian packages set up by advanced users who have recompiled some software — Ubuntu made this popular with their Personal Package Archive (PPA) service — by programmers who make their creation available to all, and even by Debian developers who offer pre-versions of their package online.
Signalons également l'existence du site mentors.debian.net, qui regroupe des paquets sources réalisés par des prétendants au statut de développeur Debian officiel ou par des volontaires souhaitant créer des paquets Debian sans passer par ce processus d'intégration. Ces paquets sont donc fournis sans aucune garantie de qualité ; prenez garde à vous assurer de leur origine et intégrité, puis à bien les tester avant d'envisager de les déployer.

COMMUNAUTÉ Les sites en debian.net

Le domaine debian.net ne constitue pas une ressource officielle du projet Debian. Chaque développeur Debian a la possibilité d'employer ce nom de domaine pour l'usage de son choix. On y trouve des services officieux (parfois des sites personnels) hébergés sur une machine n'appartenant pas au projet et mis en place par des développeurs Debian, voire des prototypes attendant d'être migrés sur debian.org. Deux raisons peuvent expliquer que certains de ces prototypes restent en debian.net : soit personne ne souhaite faire l'effort nécessaire à sa transformation en service officiel (hébergé dans le domaine debian.org et avec une certaine garantie de maintenance), soit le service est trop controversé pour être officialisé.
Installer un paquet revient à donner les droits administrateur à son concepteur, car il décide du contenu des scripts d'initialisation qui sont exécutés sous cette identité. Les paquets officiels Debian sont réalisés par des volontaires cooptés et examinés, capables de sceller leurs paquets pour en vérifier l'origine et l'intégrité.
Mais méfiez-vous a priori d'un paquet dont l'origine est incertaine et qui n'est pas hébergé sur un des serveurs officiels du projet Debian : évaluez le degré de confiance que vous accordez au concepteur et vérifiez l'intégrité du paquet.

GOING FURTHER Old package versions: snapshot.debian.org and archive.debian.org

The Debian project frequently releases new stable versions of their distribution, rendering old releases eventually outdated and unsupported (see Section 1.6, « Cycle de vie d'une release »). The repositories belonging to these releases are then removed from the official mirrors, but can still be accessed using the service at archive.debian.org. Note, that this service allows access to any of the old Debian releases, but does not provide the source package for every binary package offered.
The snapshot.debian.org service, introduced in April 2010, can be used to “go backwards in time” and to find an old binary or source version of a package not longer contained in the Debian archives. It can be used, for example, to identify which version of a package introduced a regression, and more concretely, to come back to the former version while waiting for the regression fix. This service does not only offer source and binary packages from older releases, but also versions superseeded by regular maintainer uploads.

6.1.6. Mandataire avec cache (proxy-cache) pour paquets Debian

Lorsqu'un réseau complet de machines est configuré pour télécharger les mêmes paquets mis à jour depuis le même serveur distant, tout administrateur sait qu'il serait utile d'utiliser un mandataire (proxy) configuré comme un cache (voir encadré VOCABULAIRE Cache) pour limiter le trafic induit par les multiples téléchargements.
APT peut être configuré pour utiliser un proxy « standard » (voir Section 6.2.4, « Options de configuration » pour la configuration d'APT, et Section 11.6, « Mandataire HTTP/FTP » pour la configuration du proxy lui-même), mais l'écosystème Debian offre de meilleures options pour ce problème. Les logiciels présentés dans cette section sont dédiés à cette tâche et sont souvent plus efficaces qu'un proxy générique puisqu'ils peuvent tirer parti de la structure spécifique des dépôts APT (par exemple, ils peuvent savoir quand un fichier devient obsolète et ainsi ajuster la durée pendant laquelle ce fichier est conservé).
apt-cacher et apt-cacher-ng fonctionnent comme des mandataires standards. Le fichier sources.list d'APT reste inchangé, mais APT est configuré pour utiliser ces logiciels comme mandataires lors des requêtes sortantes.
À l'opposé, approx se comporte comme un serveur HTTP qui servirait de miroir pour d'autres dépôts externes, rendus accessibles dans ses URL de plus haut niveau. La correspondance entre ces répertoires de premier niveau et les adresses distantes des dépôts est maintenue dans le fichier de configuration /etc/approx/approx.conf : 
# <name>   <repository-base-url>
debian     https://deb.debian.org/debian
security   http://security.debian.org/debian-security
approx runs by default on port 9999 via a systemd socket and requires the users to adjust their sources.list file to point to the approx server: 
# Sample sources.list pointing to a local approx server
deb http://localhost:9999/security bullseye-security main contrib non-free
deb http://localhost:9999/debian   bullseye main contrib non-free